ويتولى القسم كافة الاجراءات المتعلقة بالتالي:
- إعداد ميزانية المركز وموازنة البرامج والمشاريع.
- إعداد تكاليف تنفيذ مشاريع ودراسات المركز.
- مراجعة وتسجيل العمليات المالية ومراجعة واعتماد المدفوعات.
- إعداد الحسابات الختامية والتقارير الدورية والإحصائية لمصروفات وإيرادات المركز.
- إجراء الجرد السنوي للأصول الثابتة والاحتفاظ بالسجلات اللازمة.
- إدارة وتنمية الاستثمارات المالية للمركز.
- متابعة المشاريع البحثية للمركز من حيث الكلفة والفترات الزمنية.